Уговором о Европској унији овај суд је добио статус органа ЕУ. Европски финансијски суд надлежан је да контролише приходе и трошкове институција ЕУ, гарантује здраво финансијско управљање и омогућава Европском парламенту да одобри извршавање буџета.