Evropska komisija (EK) ima ovlašćenja da pokreće inicijative, priprema odluke Saveta EU, da ih sprovodi po usvajanju i da nadzire primenu odluka i drugih propisa na teritoriji država-članica EU. Evropska komisija, takođe, obezbeđuje sprovođenje osnivačkih ugovora i ostvarivanje interesa EU. Ima značajna izvršna ovlašćenja u odnosu na odluke koje donosi Savet. Evropska komisija predstavlja Uniju u međunarodnim ekonomskim odnosima i pregovara u ime Unije radi zaključivanja širokog spektra međunarodnih ugovora.

Predsednika Komisije predlaže Evropski savet, nakon čega se isti bira većinom glasova poslanika Evropskog parlamenta. Novi saziv Evropskog parlamenta, formiran nakon izbora održanih od 25. do 27. maja 2014. godine, za predsednika Evropske komisije izglasao je luksemburžanina Žan-Klod Junkera, koji će tu funkciju obavljati do 2019. godine. Pored predsednika, Evropska komisija ima 27 članova Komisije, od kojih su sedam potpredsednici Evropske komisije.

Oblasti nadležnosti Komisije su: saobraćaj i energetika; konkurencija; poljoprivreda, seoski razvoj i vodoprivreda; privreda i informatičko društvo; unutrašnje tržište, poreska politika i carinska unija; istraživanje; ekonomska i monetarna pitanja; razvoj i humanitarna pomoć; proširenje; spoljni poslovi; trgovina; zaštita zdravlja i potrošača; regionalna politika; obrazovanje i kultura; budzet; pravosuđe i unutrašnji poslovi; zapošljavanje i socijalna pitanja.